2002年1月，長谷部誠在高中畢業後放棄了進入大學的機會，決定成為職業足球選手。他原本希望能夠進入靜岡縣本地的清水心跳，卻在選拔中落榜，轉而加盟了位於埼玉縣的浦和紅鑽。

2004年賽季隨浦和紅鑽獲得日職聯賽亞軍，長谷部誠本人獲得了日職聯賽新人獎，入選日職聯賽最佳陣容。2005年賽季隨浦和紅鑽獲得日職聯賽亞軍和天皇杯冠軍。2006賽季隨浦和紅鑽獲得日職聯賽冠軍、天皇杯冠軍、日本超級盃冠軍。2007年賽季隨浦和紅鑽獲得亞洲冠軍聯賽冠軍和世俱杯季軍。

2008年1月18日，長谷部誠和德甲球隊狼堡足球俱樂部正式簽約。2月2日，在狼堡客場對戰比勒費爾德的比賽中，長谷部誠獲得了替換上場的機會，迎來了在德甲賽場的首次亮相。

2009年5月12日，多特蒙德與狼堡的比賽的第75分鐘，博阿滕一個飛踹直中長谷部誠的面部，導致後者被爆頭破相，面部縫了十一針。5月18日，長谷部誠入選由德國權威足球雜誌踢球者評選出的德甲聯賽第33輪最佳陣容。

2008-09賽季隨狼堡獲得德甲聯賽冠軍，長谷部誠成為繼前輩奧寺康彥之後，第二位獲得德甲聯賽冠軍頭銜的日本球員。

2013年9月1日，處於德甲球隊紐倫堡體育經理馬丁·貝德宣布與狼堡達成協議，長谷部誠轉會至紐倫堡，雙方簽約3年，轉會費約250萬歐元[2]。

2014年6月2日，德甲球隊紐倫堡官方宣布長谷部誠加盟球隊法蘭克福。

2016年12月21日，法蘭克福官方宣布，球隊與長谷部誠續約至2018年6月30日。

2017年3月6日，在德甲第23輪法蘭克福主場1-2負於弗萊堡的比賽中，長谷部誠創造了全新的紀錄。此役是長谷部誠第235次出戰德甲聯賽，一舉超越打過234場德甲的奧寺康彥，成為日本足球旅德第一人。3月24日，法蘭克福官方宣布，長谷部誠成功接受膝蓋手術，不過長谷部誠也將因此提前告別本賽季剩餘階段比賽。

2017年8月23日，法蘭克福宣布準備在冬歇期與長谷部誠簽下新的合約。

2022年5月18日，長谷部誠與法蘭克福贏得了歐霸盃冠軍，他在對陣格拉斯哥流浪的決賽中替補上場[3]，與鎌田大地成為繼2001-02年賽季效力飛燕諾的小野伸二後第二、三位揚威歐洲賽的日本球員。